כלי התקשורת הספרדיים ב-2 באוקטובר סיקרו בהרחבה את יירוט המשט לעזה על ידי צה"ל. דיווחי הבוקר אישרו את העלייה לספינות ואת מעצר הפעילים, כולל גרטה תונברג, במים בינלאומיים. חלק מכלי התקשורת ציינו את טענות הפעילים למעצר בלתי חוקי ותחושת נטישה מצד ממשלת ספרד. במהלך היום, הדיווחים התפתחו, והצביעו על כך שבעוד רוב הספינות יורטו והפעילים נעצרו, חלק מהכלים המשיכו בתחילה לכיוון עזה לפני שכולם יורטו בסופו של דבר. ישראל הודיעה כי המבצע הסתיים, קבעה שאף ספינה לא הגיעה לעזה והחלה בהכנות לגירוש העצורים לאירופה. בד בבד, הפגנות המוניות פרצו ברחבי ספרד, במחאה על יירוט המשט ועל פעולות ישראל.